Case studie

een mogelijkheid is om te werken aan eukaryote signaal transduktie (zoals egfr 
signaling referentie attached)

spatiele aspecten zie aangehechte literatuur over
a. scaffolds, grote macromoleculen die signaal routes aan zich hechten en 
hiermee signaal scheiding mogelijk maken
b. endosome trafficking,  het opnemen  van stukken membraan waaraan 
signalerende complexen hangen.
c. lipid rafts, lokaties in de memebraan met specifieke biofysische 
eigenschappen zodat een klein compartiment wordt gevormd waar vandaan signaal 
transduktie en endosome formatie kan starten

stochastische effecten
a. lage eiwit hoeveelheden op lipid rats en scaffolds
b. eiwitten kunnen in vele toestanden waardoor de hoeveelheden in 1 toestand 
laag is en daardoor fluctueert

waves
a. waves of signalerende eiwitten is een mogelijkheid volgens Boris

oscillaties en reactie diffusie
a. interessant systeem is cell cyclus regulatie in E. coli

-- 
Frank J. Bruggeman
Molecular Cell Physiology & Integrative Bioinformatics
Faculty Earth and Life Sciences (FALW) & BioCentrum Amsterdam
Vrije Universiteit, De Boelelaan 1085, 1081 HV, Amsterdam, The Netherlands
Tel : +31-20-4447248 (at department; at room M262) & +31-6-41427189 (personal 
cell phone)
Fax: +31-20-4447229
Email: frank.bruggeman@falw.vu.nl (new) (frankb@bio.vu.nl still works for five 
years)
WWW:
Personal: www.angelfire.com/scifi/frankb (e.g. personal information, MCA, 
cellular networks, kinetic modeling, modularity, philosophy of complex 
biological systems, publications, etc.)
Molecular cell physiology: http://www.bio.vu.nl/vakgroepen/mcp/
Integrative Bioinformatics: http://ibivu.cs.vu.nl/ Systems Biology: 
www.systembiology.net